Cá tra giống (10–20 g/con) được thu từ 3 tỉnh trong giai đoạn 4/2014–4/2015. Vi nấm được phân lập từ mang, bóng hơi, gan và cơ, nuôi cấy trên môi trường GYA và PDA. Định danh vi nấm dựa vào đặc điểm hình thái, sinh sản và khóa phân loại của Coker (1923) và de Hoog et al. (2000). Fusarium sp. có khuẩn lạc màu hồng nhạt, bào tử hình thuyền, có vách ngăn. Aspergillus sp. có khuẩn lạc vàng nâu, bào tử hình cầu, mọc từ thể bình. Achlya sp. và Saprolegnia sp. có túi động bào tử hình thành nhanh, bào tử có tiên mao bơi tự do. Mucor sp. có túi bào tử hình cầu, cuống dài không phân nhánh. Thí nghiệm sinh học cho thấy vi nấm phát triển mạnh ở 28–33°C, giảm rõ ở 38°C, Fusarium sp. không phát triển ở 38°C. Độ mặn ảnh hưởng tiêu cực đến sinh trưởng, Achlya sp. và Saprolegnia sp. không phát triển ở 2% NaCl. pH tối ưu là 5–7, Fusarium sp. và Aspergillus sp. không phát triển ở pH ≤3 hoặc ≥10. Tất cả các chủng đều sử dụng tốt glucose, sucrose và maltose. Nghiên cứu lần đầu tiên ghi nhận Mucor sp. nhiễm trên cá tra giống tại Việt Nam.