Phân tích trình tự bộ gen của chủng virus hoại tử mô tạo máu HLJ-09 tại Trung Quốc

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Virus IHNV HLJ-09 được phân lập từ cá hồi cầu vồng chết do bệnh cấp tính tại trạm thực nghiệm Bohai, Trung Quốc năm 2009.  

Trình tự bộ gen hoàn chỉnh gồm 11.132 nucleotide, mã số GenBank: JX649101.  

Bộ gen gồm 6 gen mã hóa: N, P, M, G, NV, L, theo thứ tự 3'-N-P-M-G-NV-L-5'.  

Phân tích trình tự cho thấy HLJ-09 có độ tương đồng cao với các chủng IHNV từ Hàn Quốc và Nhật Bản, đặc biệt gen G giống tới 97.9% với chủng RtGu01.  

Phân tích cây phát sinh chủng loài cho thấy HLJ-09 thuộc kiểu gen JRt, có thể có nguồn gốc từ Hàn Quốc hoặc Nhật Bản.  

Gen G có 11 acid amin đặc trưng cho kiểu gen JRt, trong đó có 4 vị trí đặc trưng riêng cho HLJ-09.  

Trình tự vùng đầu 3' và 5' của bộ gen cho thấy có sự bổ sung và biến đổi đặc trưng, ảnh hưởng đến cấu trúc sao chép virus.  

Nghiên cứu cung cấp dữ liệu sinh học phân tử quan trọng cho việc phát triển vắc-xin IHNV và nghiên cứu dịch tễ học phân tử.