Cá được chia làm hai nhóm: nhóm thử thách bằng N. seriolae (1.0 × 10⁹ CFU/mL) và nhóm đối chứng tiêm PBS; sau 48 giờ, thu máu và tách lympho để phân tích RNA; tổng số reads thu được là ~50 triệu reads mỗi nhóm, với >87% chất lượng Q30 và ~75% reads ánh xạ vào bộ gen cá lóc phương Bắc (*C. argus*); có 2.892 DEGs, trong đó 1.387 gen tăng và 1.505 gen giảm; các gen miễn dịch giảm biểu hiện gồm CD4, CD40, IL-6, IL-8, TCR, IgM, CIITA, TNFRSF10B, TLR1, TLR22, MyD88, NFKB, IRF3, TAP1/2, CASP8, CD22, CD3d, CD28, CD40L, FASL, CCR9, CXCR4, PIGR; các gen tăng biểu hiện gồm HSP70, CANX, CALR, CD59, CD121, CD35, EPOR, TLR5, TLR7, TLR9, CD71, PRF1; phân tích GO cho thấy các gen liên quan đến quá trình miễn dịch, trình diện kháng nguyên, hoạt động thụ thể cytokine, phức hợp MHC I/II bị giảm mạnh; phân tích KEGG cho thấy các con đường miễn dịch như xử lý kháng nguyên, dòng tế bào tạo máu, mạng miễn dịch ruột sản xuất IgA, độc tính qua trung gian tế bào NK, tín hiệu Toll-like đều bị ảnh hưởng; biểu hiện gen được xác nhận bằng qRT-PCR cho thấy kết quả RNA-seq đáng tin cậy; nghiên cứu đề xuất các gen CD4, IgM, IFN-γ, TCR là chỉ thị miễn dịch tiềm năng cho phát triển vaccine phòng bệnh nocardiosis ở cá.