Các locus tính trạng số lượng liên quan đến khả năng kháng Flavobacterium psychrophilum ở cá hồi vân: ảnh hưởng của phương thức gây nhiễm và bằng chứng về tương tác epistasis

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Sử dụng hai dòng cá hồi vân isogenic (AP2 kháng, B57 mẫn cảm) để tạo dòng F2 DH phục vụ phân tích QTL.  

Thử nghiệm gây nhiễm bằng hai phương pháp: tiêm trực tiếp và ngâm, mô phỏng nhiễm tự nhiên.  

Phát hiện 15 QTL liên quan đến kháng bệnh, chỉ có 3 QTL chung giữa hai phương pháp gây nhiễm.  

QTL Omy3 và Omy29 có ảnh hưởng mạnh nhất, giải thích 12–18% biến dị kiểu hình.  

Phân tích tương tác epistatic cho thấy hai kiểu tương tác: “bù trừ” và “tăng cường” giữa các QTL.  

Một số QTL chỉ được phát hiện khi xét đến tương tác giữa các vùng di truyền.  

Kết hợp dữ liệu QTL với phân tích biểu hiện gen trước đó, xác định 49 gen ứng viên liên quan đến miễn dịch: cảm biến vi khuẩn (TLR2, CD209), yếu tố viêm (IL1R2, STEAP4), gen kích hoạt interferon (IFI44, VIG2), và gen tiêu diệt vi khuẩn (C3, HAMP).  

QTL Omy3 được xác nhận ở nhiều quần thể khác nhau, có tiềm năng ứng dụng trong chọn giống kháng bệnh.  

Nghiên cứu cung cấp bằng chứng đầu tiên về vai trò của epistasis trong kháng F. psychrophilum và ảnh hưởng của phương pháp gây nhiễm đến cơ chế kháng bệnh.