Cá trắm cỏ được chia thành nhóm đối chứng và nhóm thiếu oxy (DO = 1.0 ± 0.2 mg/L), xử lý trong 2, 4 và 7 ngày. Phân tích 2-DE cho thấy 372 ± 11 điểm protein ở nhóm thiếu oxy và 406 ± 14 điểm ở nhóm đối chứng. 15 điểm protein thay đổi rõ rệt, gồm:

   - Tăng biểu hiện: TLR4, isocitrate dehydrogenase, L-lactate dehydrogenase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, ephx1, Ran protein.

   - Giảm biểu hiện: ATP synthase subunit beta, citrate synthase, keratin type II, cytokeratin type I, ARP3, tropomyosin 2 và 3, thraa.

   - 6 protein liên quan đến HIF-1: TLR4, ICDH, LDH, GAPDH (tăng); ATP synthase, citrate synthase (giảm).

   - Mang cá tái cấu trúc để tăng trao đổi oxy: tăng chiều cao lá mang, giảm khối tế bào giữa lá.

   - TLR4 và Ran protein cho thấy vai trò miễn dịch trong phản ứng với thiếu oxy.

   - ICDH tăng biểu hiện để cung cấp NADPH, hỗ trợ hệ thống chống oxy hóa.