Vi sinh vật nội sinh là các vi khuẩn và nấm sống bên trong mô cây mà không gây hại, có thể cạnh tranh sinh học với mầm bệnh và sâu hại. Chúng có khả năng tiết ra các chất kháng sinh, enzyme phân giải, hoặc kích hoạt cơ chế kháng bệnh toàn thân của cây. Bài viết tổng hợp các nghiên cứu về khả năng kiểm soát sinh học của vi sinh vật nội sinh đối với các bệnh nguy hiểm như bệnh héo rũ, thối rễ, cháy lá, và các loài sâu hại như bọ cánh cứng, sâu đục thân, rệp sáp. Ngoài ra, bài viết cũng phân tích các phương pháp phân lập, nhận diện, và ứng dụng vi sinh vật nội sinh, bao gồm cả công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) và phân tích metagenome. Tuy nhiên, việc ứng dụng thực tế còn gặp nhiều khó khăn như khả năng xâm nhập vào mô cây, ảnh hưởng đến hệ vi sinh vật bản địa, và hiệu quả không ổn định trong điều kiện môi trường biến đổi. Tác giả đề xuất cần có thêm nghiên cứu về cơ chế tương tác, thời điểm và phương pháp đưa vi sinh vật vào cây, cũng như đánh giá tác động sinh thái lâu dài.