Vi sinh vật tại bãi chôn lấp thực hiện các quá trình thủy phân, lên men, acetogenesis và methanogenesis, chuyển hóa chất thải hữu cơ thành khí methane và CO₂. Các nhóm vi sinh vật chính gồm vi khuẩn, nấm và archaea, với sự tương tác chặt chẽ giữa các nhóm trong điều kiện yếm khí. Công nghệ metagenomics và giải trình tự thế hệ mới (NGS) đã mở rộng khả năng nhận diện cộng đồng vi sinh vật, phát hiện nhiều loài mới và cơ chế phân hủy chưa từng được mô tả. Các yếu tố sinh thái như độ ẩm, nhiệt độ, pH và oxy ảnh hưởng mạnh đến cấu trúc cộng đồng vi sinh và hiệu suất xử lý. Bài viết cũng chỉ ra tiềm năng khai thác enzyme và chất chuyển hóa từ vi sinh vật bãi rác cho ứng dụng công nghiệp, đồng thời đề xuất hướng nghiên cứu sâu hơn về chức năng gen và cơ chế phân hủy để nâng cao hiệu quả quản lý chất thải.