Ứng dụng dấu vân tay phân tử và proteomic trong định danh và theo dõi vi khuẩn Streptococcus gây bệnh cá

( 0 đánh giá )
Miễn phí

44 chủng Streptococcus được phân tích gồm S. parauberis (16 chủng) và S. iniae (28 chủng), cùng các chủng tham chiếu khác  

Phân nhóm huyết thanh học xác định serotype III mới của S. parauberis từ cá bơn, không phản ứng chéo với các serotype từ cá flounder  

Thử nghiệm gây bệnh cho thấy serotype III gây chết cấp tính ở cá bơn (LD50 = 2.82 × 10³ CFU/con), các serotype khác ít độc hoặc không độc  

REP-PCR phân biệt rõ các chủng Streptococcus theo loài và serotype, với các băng đặc trưng cho từng nhóm  

MALDI-TOF-MS xác định các đỉnh khối lượng đặc trưng cho từng loài và serotype, ví dụ:  

– S. parauberis: m/z 4752.78, 9501.23, 5926.63, 13,237.12  

– S. iniae: m/z 4135.82, 6353.12, 8270.44  

Các đỉnh được gán cho protein ribosome, protein liên kết DNA, protein stress và protein vận chuyển đường  

Phân tích PCA và cluster xác nhận khả năng phân biệt chủng theo loài và serotype bằng MALDI-TOF-MS  

Độ tương quan giữa các phương pháp: REP-PCR vs MALDI-TOF-MS (Rand = 0.662), MALDI vs serotyping (Rand = 0.794)  

Kết luận: MALDI-TOF-MS là công cụ tiềm năng để định danh nhanh, phân nhóm chủng Streptococcus gây bệnh cá, thay thế phương pháp truyền thống, giảm chi phí và thời gian