Một số nghiên cứu gần đây đã chứng minh cho sự xuất hiện của kháng sinh trong nước sông Sài Gòn nhưng có rất ít thông tin về sự hiện diện và tương quan của nó với chất lượng nước. Trong nghiên cứu này, 2 kháng sinh tiêu biểu là Ciprofloxacin (Cip) và Ofloxacin (Ofl) được lựa chọn nghiên cứu về tương quan với thông số chất lượng nước. Kết quả cho thấy, biến động nồng độ kháng sinh là tăng dần từ vùng đầu nguồn (nồng độ trung bình của Cip khoảng 81 ng/l và Ofl khoảng 59 ng/l) đến giữa đoạn sông (Cip 269 ng/l và Ofl 207 ng/l) và cuối nguồn (Cip 341 ng/l và Ofl 276 ng/l). Nồng độ kháng sinh ở vùng đầu nguồn nhỏ hơn rất nhiều lần so với giá trị trung bình toàn khu vực với mức chênh lệch khoảng 226,3% đối với Cip (nồng độ trung bình khoảng 265,0 ng/l) và 253,0% đối với Ofl (nồng độ trung bình khoảng 209 ng/l).