So sánh quá trình sinh thái và chức năng vi sinh vật đường ruột giữa tôm khỏe và tôm bệnh

( 0 đánh giá )
Miễn phí

– Mẫu: tôm thẻ chân trắng (Litopenaeus vannamei) từ 7 ao nuôi (4 khỏe, 3 bệnh), 9 mẫu mỗi nhóm  

– Phân tích: 16S rRNA Illumina, phân loại OTU, chuẩn hóa bằng PICRUSt để dự đoán chức năng KEGG  

– Mô hình trung tính:  

   • Tôm khỏe: 52.4% OTU phân bố trung tính, 15.8% quá đại diện, 2.5% dưới đại diện  

   • Tôm bệnh: 74.9% trung tính, 9.6% quá đại diện, 0.9% dưới đại diện  

   • Tỷ lệ di cư vi khuẩn cao hơn ở tôm bệnh → giảm lọc chọn của vật chủ  

– Mô hình ecosphere: quá trình định hướng giảm 55.4% ở tôm bệnh  

– Mạng tương tác vi khuẩn:  

   • Tôm khỏe: 681 OTU, 1469 liên kết, 73% tương tác dương  

   • Tôm bệnh: 823 OTU, 1349 liên kết, 51.9% tương tác dương  

   • Vi khuẩn chủ chốt: tôm khỏe → Alphaproteobacteria, Actinobacteria; tôm bệnh → Gammaproteobacteria  

– Chức năng KEGG:  

   • Tôm bệnh tăng các đường liên quan đến nhiễm khuẩn (focal adhesion, Helicobacter pylori, Shigellosis)  

   • Giảm các đường miễn dịch và trao đổi chất (lysosome, endocytosis, peroxisome)  

– Kết luận: bệnh làm tăng tính ngẫu nhiên trong lắp ráp cộng đồng vi khuẩn, giảm tương tác cộng sinh, thay đổi chức năng sinh học → gợi ý hướng chọn probiotic và kiểm soát bệnh