Phát hiện biomarker trong quá trình hình thành biofilm của Burkholderia pseudomallei bằng khối phổ MALDI-TOF nguyên bào

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Bối cảnh:

  + B. pseudomallei là vi khuẩn Gram âm, hiếu khí, gây melioidosis, khó điều trị do kháng nhiều loại kháng sinh và chưa có vắc-xin.

  + Biofilm giúp vi khuẩn tăng khả năng tồn tại, kháng kháng sinh gấp 100–1000 lần so với dạng planktonic.

  + Hiểu biết về quá trình hình thành biofilm của B. pseudomallei còn hạn chế.

  • Mục tiêu:
  •   + Ứng dụng MALDI-TOF MS nguyên bào để phát hiện protein đặc trưng liên quan đến biofilm.
  • - Phương pháp:
  •   + Hai chủng lâm sàng: 354 (nhiều biofilm) và U2704 (ít biofilm).
  •   + Nuôi trong môi trường LB (planktonic) và MVBM (kích thích biofilm), thu mẫu 8–48h.
  •   + Phân tích phổ khối 2–20 kDa, xử lý dữ liệu bằng ClinProTools™, PCA, Quick Classifier.
  •   + Tìm kiếm protein ứng viên trong UniProtKB, xác nhận bằng PCR và qRT-PCR.
  • - Kết quả chính:
  •   + Phổ khối của chủng 354 trong MVBM có dạng chu kỳ theo thời gian (8, 24, 40h có tín hiệu mạnh).
  •   + PCA phân biệt rõ hai chủng; chủng 354 có biến thiên phổ lớn hơn.
  •   + Marker ứng viên: amylo-alpha-1,6-glucosidase (7174 Da) – có mặt trong cả hai chủng, nhưng biểu hiện cao hơn ở 354 và trong môi trường biofilm.
  •   + qRT-PCR: biểu hiện gen trong MVBM cao hơn LB ~3 lần (354) và ~1 lần (U2704).
  •   + Mức biểu hiện tăng ở hầu hết các thời điểm, trừ 16h.
  • - Diễn giải:
  •   + Amylo-alpha-1,6-glucosidase có thể tham gia vào cấu trúc hoặc chuyển hóa trong ma trận biofilm, liên quan đến thành phần carbohydrate (glucose).
  •   + Là marker sinh học tiềm năng để nhận diện khả năng tạo biofilm.
  • - Kết luận:
  •   + MALDI-TOF MS nguyên bào kết hợp chủng đối chứng là phương pháp hữu ích phát hiện protein liên quan biofilm.
  •   + Amylo-alpha-1,6-glucosidase là ứng viên đáng chú ý, cần nghiên cứu thêm về chức năng và ứng dụng.