Tổng cộng 48662 Unigenes được lắp ráp từ 312.77 Mb dữ liệu sạch, với 24 gen miễn dịch được chọn lọc gồm các nhóm gen tương tác với mầm bệnh (mucin, chitinase, chitin deacetylase), PRRs và DAMPs (C-type lectin, galectin, HMGB1), gen kích hoạt tín hiệu miễn dịch (STAT, Toll, IMD, TBK1), peptide kháng khuẩn (ALF, penaeidin, stylicin), hệ proPO (serine proteinase, SERPIN, proPO), gen chống oxy hóa (SOD, GPx), gen thực bào và apoptosis (lysozyme, caspase, p53), và các gen khác như DSCAM và prostaglandin D synthase; biểu hiện gen được xác nhận bằng qRT-PCR cho 4 gen tiêu biểu (C-type lectin, IMD, ALF, HMGB1); kết quả cho thấy trình tự đáp ứng miễn dịch bắt đầu từ tương tác với mầm bệnh, kích hoạt PRRs, dẫn đến các tín hiệu miễn dịch, sản sinh AMPs, kích hoạt hệ proPO và thực bào, sau đó là phản ứng chống oxy hóa và ghi nhớ miễn dịch; nghiên cứu đề xuất các gen như C-type lectin, IMD, ALF, HMGB1, serine proteinase và DSCAM làm biomarker tiềm năng để phát hiện sớm AHPND và phát triển vaccine miễn dịch cho tôm.