Bối cảnh:

  + IBDV gây bệnh Gumboro, làm suy giảm miễn dịch, tăng nguy cơ nhiễm trùng thứ phát.

  + Virus thuộc họ Birnaviridae, genome RNA sợi kép, không vỏ bọc, gồm 2 đoạn (A và B).

  + Phân loại truyền thống dựa trên tính kháng nguyên/độc lực: cổ điển, biến thể, rất độc lực.

  + Vùng siêu biến VP2 quyết định tính kháng nguyên, là mục tiêu chính để phân tích di truyền.

• Phương pháp:
•   + Thu thập mẫu bursa từ các trại gà nghi nhiễm ở Punjab, Pakistan.
•   + Bảo quản lạnh, chiết RNA, tổng hợp cDNA, khuếch đại vùng siêu biến VP2 (~782 bp).
•   + Giải trình tự Sanger, so sánh với GenBank, phân tích phát sinh loài bằng MEGA6 (Neighbor-Joining, bootstrap 1000).
•   + Đối chiếu dấu hiệu di truyền (marker) tại các vị trí aa đặc trưng (222, 242, 256, 279, 294, 299).
• Kết quả chính:
•   + Các chủng phân bố vào 7 nhóm gen (G-1 → G-7) theo Jackwood:
•      G-1*: Cổ điển, phân bố toàn cầu, nhiều chủng vaccine (D78, Lukert…).
•      G-2*: Biến thể kháng nguyên, chủ yếu ở Mỹ & Nam Mỹ.
•      G-3*: vvIBDV, lưu hành rộng, nhiều biến đổi ở Malaysia, Indonesia, Jordan.
•      G-4*: dIBDV, trước đây chủ yếu ở Nam Mỹ, nay có ở UAE.
•      G-5*: Tái tổ hợp biến thể/cổ điển, chưa ghi nhận ở Pak-Asian.
•      G-6*: ITA, nguồn gốc Ý, xuất hiện ở Trung Đông, Nga.
•      G-7*: Nguồn gốc Úc, hạn chế vùng.
•   + 17/20 mẫu Pakistan thuộc G-1 và G-3; không phát hiện G-5, G-6, G-7.
•   + Một số đột biến đáng chú ý ở các vùng hydrophilic A, B liên quan đến thay đổi kháng nguyên.
• Diễn giải:
•   + G-1 và G-3 chiếm ưu thế toàn cầu, liên quan nhiều đến dịch bệnh và thất bại vaccine.
•   + Đột biến tại aa 222, 299, 321 có thể ảnh hưởng khả năng trung hòa kháng thể.
•   + Áp lực chọn lọc từ tiêm vaccine diện rộng có thể thúc đẩy biến đổi di truyền.
•   + Phân loại theo nhóm gen giúp nhận diện rõ hơn sự lưu hành và tiến hóa của IBDV.
• Kết luận:
•   + Các chủng IBDV Pak-Asian chủ yếu thuộc 3 nhóm gen đầu.
•   + Nhóm gen phổ biến toàn cầu và nhóm gen khu trú tồn tại song song.
•   + Cần giám sát di truyền liên tục để điều chỉnh chiến lược vaccine.