Công cụ chẩn đoán được xây dựng dựa trên khung lý thuyết gồm ba thành phần: (1) đặc điểm bối cảnh (sản phẩm, quy trình, tổ chức, môi trường chuỗi cung ứng), (2) các hoạt động kiểm soát hậu cần và chất lượng cốt lõi, và (3) đầu ra hệ thống là tổn thất sau thu hoạch. Các hoạt động hậu cần cốt lõi gồm: lập kế hoạch sản lượng thu hoạch và xử lý, lựa chọn chính sách xuất kho, phương tiện vận chuyển, và lịch trình vận chuyển. Các hoạt động kiểm soát chất lượng cốt lõi gồm: xác định độ chín khi thu hoạch, thời điểm thu hoạch, thực hành thu hoạch, phân loại, đóng gói, bảo quản, theo dõi nhiệt độ và độ ẩm, bảo trì thiết bị. Công cụ sử dụng các bảng mô tả mức độ thực hiện (từ thấp đến cao) và mức độ dễ tổn thương (từ thấp đến cao) để đánh giá từng yếu tố. Nghiên cứu thực địa được thực hiện với 36 nông dân trồng cà chua tại Zimbabwe, chia thành ba nhóm theo quy mô và mục tiêu sản xuất. Phân tích cụm cho thấy hai nhóm chính: nhóm nông dân thương mại (quy mô lớn và một phần quy mô nhỏ) có mức tổn thất trung bình 1%, trong khi nhóm nông dân tự cung tự cấp có mức tổn thất trung bình 3%. Các yếu tố góp phần vào sự khác biệt này gồm: hệ thống canh tác (nhà kính vs ngoài trời), giống cây trồng (lai tạo kháng bệnh vs giống địa phương), phương tiện vận chuyển (xe tải kín vs xe thô sơ), vật liệu đóng gói (thùng nhựa vs thùng gỗ), và mức độ đầu tư vào cơ sở hạ tầng sau thu hoạch. Công cụ chẩn đoán cho phép xác định các điểm yếu trong hệ thống và đề xuất các biện pháp cải tiến phù hợp với nguồn lực của từng nhóm nông dân.