Hệ thống điều khiển vi thao tác được thiết kế để hỗ trợ các ứng dụng vi sản xuất và phân tích tế bào đơn. GUI cho phép người dùng điều khiển đầu thao tác bằng chuột, thực hiện các chuyển động đơn, chuỗi chuyển động, hoặc chuyển động liên tục theo vị trí chuột. Hệ thống sử dụng xử lý ảnh để phát hiện vị trí đầu thao tác và cung cấp phản hồi theo vòng kín. Các thử nghiệm cho thấy phương pháp điều khiển bằng GUI có độ chính xác cao hơn và thời gian thao tác ngắn hơn so với joystick truyền thống. Phản hồi tỷ lệ giúp giảm sai số vị trí xuống dưới 1 pixel. Hệ thống có thể mở rộng để tích hợp thêm thiết bị và phù hợp với nhiều loại người dùng, kể cả người khuyết tật.