Dự đoán định lượng tỷ lệ mắc bệnh ở tôm thông qua hồ sơ vi sinh vật nhân thực trong ruột

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Cộng đồng vi sinh vật nhân thực trong ruột tôm thay đổi theo tuổi và bị xáo trộn khi bệnh xuất hiện.  

Mô hình ngẫu nhiên cho thấy quá trình hình thành cộng đồng ruột ở tôm khỏe là có tính quyết định cao, nhưng chuyển sang ngẫu nhiên khi bệnh tiến triển.  

Sử dụng giải trình tự gen 18S rRNA để phân tích 81 mẫu ruột tôm từ giai đoạn hậu ấu trùng đến trưởng thành, bao gồm cả tôm bệnh.  

Phân tích Random Forest xác định 17 loài vi sinh vật nhân thực phân biệt rõ giữa tôm khỏe và tôm bệnh, với độ chính xác dự đoán lên đến 92.4%.  

Malassezia OTU6885 là chỉ thị bệnh quan trọng nhất, tăng mạnh ở tôm bệnh và có tương tác cộng sinh với các loài khác.  

Ngược lại, các loài như Aplanochytrium, Ulvophyceae, Bacillariophyceae có vai trò bảo vệ, bị suy giảm ở tôm bệnh.  

Mạng lưới tương tác giữa các loài vi sinh vật cho thấy sự chuyển đổi từ cạnh tranh sang hợp tác khi bệnh xuất hiện, làm mất ổn định hệ vi sinh vật ruột.  

Mô hình có thể chẩn đoán chính xác giai đoạn khởi phát bệnh, ngay cả khi chưa có triệu chứng rõ rệt.  

Kết luận: Vi sinh vật nhân thực trong ruột tôm đóng vai trò quan trọng trong sức khỏe vật chủ; mô hình dựa trên chỉ thị vi sinh vật có tiềm năng ứng dụng trong giám sát và phòng ngừa bệnh tôm.