Đánh giá thành phần cộng đồng vi khuẩn trong trầm tích sông Cauvery bị ô nhiễm uranium bằng phân tích metagenomic

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Tổng số 11.14 triệu cặp đọc được tạo ra từ hai mẫu, sau lọc chất lượng còn lại ~70% dữ liệu.

  • Mẫu UP có chỉ số Shannon thấp hơn (4.2) so với mẫu UNP (4.9), cho thấy đa dạng vi khuẩn bị suy giảm do ô nhiễm uranium.
  • - Các lớp vi khuẩn chiếm ưu thế trong mẫu UP: Gammaproteobacteria, Alphaproteobacteria, Deltaproteobacteria.
  • - Các chi phổ biến: Photobacterium, Halomonas, Idiomarina, Marinobacter, Aeromonas.
  • - Phân tích SIMPER cho thấy các loài như Photobacterium damselae, Halomonas aquamarina, Cellulophaga fucicola đóng góp lớn vào sự khác biệt giữa hai mẫu.
  • - Phân tích PCoA và heatmap xác nhận sự phân tách rõ rệt giữa hai cộng đồng vi khuẩn.
  • - Tỷ lệ vi khuẩn gram âm, sinh bào tử, kỵ khí cao hơn trong mẫu UP, phản ánh khả năng thích nghi với môi trường ô nhiễm.
  • - Các loài hiếm trong mẫu UNP trở nên phổ biến trong mẫu UP, đặc biệt là các loài có khả năng hấp phụ hoặc khử uranium.