Đặc điểm hệ gen, vị trí phát sinh và định vị nội mô của virus đơn chuỗi âm mới ở Lepeophtheirus salmonis

( 0 đánh giá )
Miễn phí

LsNSRV-1 có bộ gen dài 12,434 nt, gồm 5 ORF: ORF I, II, III, glycoprotein (G), và polymerase (L)  

ORF I, III và L có tín hiệu định vị nhân (NLS) và xuất nhân (NES), gợi ý virus nhân bản trong nhân tế bào  

RNA virus hiện diện trong nhiều mô của salmon louse: mô thần kinh, mô liên kết, biểu mô ruột, tuyến ngoại tiết, tuyến xi măng, tinh hoàn, túi tinh, buồng trứng, noãn  

In situ hybridization cho thấy RNA virus có mặt cả trong nhân và hạch nhân của tế bào bị nhiễm  

Tỷ lệ nhiễm LsNSRV-1 rất cao (~97%) ở tất cả các giai đoạn phát triển của salmon louse  

RNAi bằng dsRNA nhắm vào ORF I gây giảm biểu hiện RNA virus ở cá thể cái (83.5%) nhưng không ổn định ở cá thể đực và đời con  

Virus hiện diện trong túi tinh và noãn → có khả năng truyền dọc từ cả bố và mẹ  

Virus không nhân bản được trong các dòng tế bào cá hồi (BF-2, CHSE-214, ASK, RT-Gill-W1)  

LsNSRV-1 được xếp vào họ Artoviridae, gần với các virus arthropod như PpNSRV-1, Beihai barnacle virus 8…  

Protein ORF I có vùng giàu proline và motif YPDL, gợi ý vai trò trong quá trình budding của virus  

ORF III có hai vùng coil-coil và motif late domain (PFSAP, LDRLF), có thể là protein matrix hoặc phosphoprotein  

ORF IV là glycoprotein có vùng peptide tín hiệu và vùng xuyên màng, có glycosyl hóa N và O  

ORF V là polymerase RNA phụ thuộc RNA, có các motif bảo tồn cho chức năng sao chép và mRNA capping  

Virus không gây bệnh rõ rệt cho salmon nhưng có thể ảnh hưởng đến phản ứng miễn dịch của cá khi bị louse nhiễm virus  

Nghiên cứu góp phần hiểu rõ hệ virus của salmon louse và tiềm năng ảnh hưởng đến nuôi cá hồi