Các cách tiếp cận proteomic so sánh để phân tích sự lão hóa thịt quả vải sau thu hoạch

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Nguyên liệu: vải cv. ‘Guiwei’ chín thương mại, xử lý Sportak 0,1%, bảo quản 25 °C, RH 85–90%, lấy mẫu 1d, 3d, 6d; 3 lặp sinh học.  

Chỉ tiêu: TSS giảm dần, hô hấp đạt đỉnh ngày 3.  

Proteomic: trích protein, chạy 2-DE, nhuộm CBB, phân tích PDQuest, tiêu chí ≥2×, p<0,05; cắt giải, đồng vị hóa, định danh LC-ESI-MS/MS, chú giải Blast2GO.  

Kết quả phân loại: BP gồm dẫn truyền tín hiệu (11 protein, 3 TF NAC, AP2/ERF, RF2b; auxin-induced PCNT115; ACC oxidase; kinase; HDAC; DNA methyltransferase; protein gắn RNA, zinc finger), chuyển hóa sơ cấp (sucrose, galactose, vit B2), thứ cấp (CAD1, tropinone reductase, sterol reductase, prephenate dehydratase ↑; CHI ↓), lipid (phospholipase Dα, enoyl-CoA hydratase, esterase precursor ↑), thành tế bào (XTH/XET ↑; β-glucanase ↑; UDP-glucuronic acid decarboxylase ↓; UDP-xylose synthase ↑), năng lượng (aconitase, hexokinase, malate dehydrogenase, ATP synthase β ↓; ADH, methylmalonate– và 1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase ↑), stress (peroxidase 4, Mn-SOD, Cu/Zn-SOD, catalase ↓; glutaredoxin, methionine sulfoxide reductase, thaumatin-like ↑), protein (ubiquitin E2, E3, protease ↑; eIF5A ↓).  

qRT-PCR 12 gen từ các pathway trên xác nhận xu hướng proteomic.  

Bàn luận: auxin và ethylene cùng tham gia điều hòa; epigenetic điều chỉnh biểu hiện; thay đổi đường và hợp chất thơm; lipid và thành tế bào bị phân giải mạnh; suy giảm hô hấp hiếu khí và ATP dẫn tới tăng hô hấp kỵ khí; hệ thống chống oxy hóa enzym bị suy giảm; phân giải protein qua ubiquitin–proteasome tăng.  

Kết luận: senescence thịt quả vải là kết quả của nhiều sự kiện phối hợp, cung cấp hiểu biết cơ chế ở mức protein cho bảo quản và xử lý sau thu hoạch.