– Tôm được thu từ các ao ở Ningbo, Trung Quốc; mật độ thả 360,000 con/ao  

– Bệnh xảy ra ở các ao khác nhau vào ngày 70, 80, 85 sau thả giống → triệu chứng giống AHPND  

– Tổng cộng 58 mẫu tôm (31 khỏe, 27 bệnh) được phân tích bằng Illumina MiSeq (vùng V3–V4 của gen 16S rRNA)  

– Tôm bệnh có alpha-diversity thấp hơn, cộng đồng vi khuẩn phân tán hơn, ít ổn định hơn theo thời gian  

– PERMANOVA: trạng thái sức khỏe giải thích biến thiên cộng đồng vi khuẩn tốt hơn thời gian  

– SIMPER: xác định 41 OTUs phân biệt giữa tôm khỏe và bệnh, trong đó:  

   • Rhodobacteraceae chiếm ưu thế ở tôm khỏe  

   • Vibrionaceae chiếm ưu thế ở tôm bệnh  

– BNTI:  

   • Tôm khỏe: chọn lọc đồng nhất (BNTI < -2) → cộng đồng ổn định  

   • Tôm bệnh: chuyển từ chọn lọc dị biệt (BNTI > +2) → đồng nhất → ngẫu nhiên theo thời gian  

– Core microbiota:  

   • Tôm khỏe: 42 OTUs, chủ yếu Rhodobacteraceae (60.1%), Flammeovirgaceae (10.5%)  

   • Tôm bệnh: 7 OTUs, chủ yếu Vibrionaceae (94.8%)  

   • Shared core: 10 OTUs, chủ yếu Rhodobacteraceae  

– Mạng tương tác vi sinh vật:  

   • Tôm khỏe: 52 nodes, 179 edges, nhiều liên kết cộng sinh  

   • Tôm bệnh: 17 nodes, 97 edges, tỷ lệ loại trừ cao (53%)  

   • Loại trừ chủ yếu giữa Vibrionaceae và Rhodobacteraceae  

– Gợi ý: Rhodobacteraceae có thể là probiotic tiềm năng, giúp duy trì cân bằng vi sinh vật ruột và phòng bệnh