Biểu hiện gen alpha-amylase và beta-amylase cung cấp hiểu biết về cơ chế phân tử phản ứng của cây trà (Camellia sinensis) đối với stress và xử lý sau thu hoạch

( 0 đánh giá )
Miễn phí

Xác định 3 gen CsAMY và 9 gen CsBAM từ cơ sở dữ liệu genome và transcriptome cây trà  

Phân tích sinh học: trọng lượng phân tử, điểm đẳng điện, vị trí nội bào, độ ưa nước  

CsAMY chia thành 3 nhóm: AMY1 (tiết ra), AMY2 (tế bào chất), AMY3 (lục lạp)  

CsBAM chia thành 4 nhóm: nhóm II (CsBAM1, 3, 6), nhóm IV (CsBAM2, 7, 8), nhóm I (CsBAM4, 5), nhóm III (CsBAM9)  

CsBAM1, 2, 3, 5 có vùng xúc tác bảo tồn, khả năng hoạt động enzyme cao  

CsBAM7, 8 có vùng BZR1, hoạt động như yếu tố phiên mã trong nhân  

Phân tích motif bảo tồn cho thấy sự khác biệt giữa các nhóm CsAMY và CsBAM  

Dự đoán cấu trúc 3D cho thấy vùng xúc tác kiểu TIM-barrel và các vị trí liên kết Ca²⁺  

Phân tích vùng promoter: giàu cis-element liên quan đến stress (ABRE, MYB, STRE, LTR…), ánh sáng, hormone  

Biểu hiện theo mô: CsBAM3 cao ở lá, CsBAM9 cao ở hoa, CsAMY1/2 cao ở rễ và hạt  

Biểu hiện theo stress: CsBAM3 tăng mạnh dưới ABA, lạnh, hạn, muối; CsAMY1/2 cũng tăng  

Biểu hiện trong chế biến trà: CsAMY1, CsBAM1, 3, 4, 9 tăng trong quá trình héo trà trắng; CsBAM3, 5, 7 tăng trong xoay trà ô long  

CsBAM3 có vai trò trung tâm trong phản ứng stress và điều hòa chất lượng trà  

Kết luận: CsAMY và CsBAM là mục tiêu tiềm năng để cải thiện khả năng chống chịu và chất lượng trà sau thu hoạch